Il Museo dedicato a Bonaventura da Potenza ha sede nella Chiesa e vi si accede attraverso la navata sinistra. In una grande sala cinque teche custodiscono urne, messali, la tegola utilizzata dal Beato come guanciale, paramenti liturgici e strumenti di penitenza. Sono esposti inoltre ex voto in argento, oggettuali e fotografie di graziati.