Il Castello dei Burattini si sviluppa al pian terreno del Monastero di S. Paolo. L'allestimento museale si sviluppa su due itinerari: quello al centro delle sale, all'interno di strutture a teatrino, riguarda le marionette; quello alle pareti, all'interno di scaffalature verticali, i burattini. I percorsi sono arricchiti con l'esposizione di locandine, manifesti, avvisi, apparati scenografici, copioni, allo scopo di ricreare il contesto storico realativo ai pupazzi esposti. Inoltre, gli ambienti del Castello dei Burattini prevedono un deposito in cui sono custoditi i fondi collezionisitci acquisiti nel corso degli anni; un Centro Studi che mette a disposizione degli studiosi i documenti d'archivio; una sala per gli spettacoli; un laboratorio didattico.